MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 47437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	CTT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009515	TTC	2	6	65	70	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009515	TTC	2	6	77	82	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009515	TTTTA	3	15	107	121	20 %	80 %	0 %	0 %	148642061
5	NC_009515	TCA	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
6	NC_009515	ACA	2	6	217	222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
7	NC_009515	TCA	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
8	NC_009515	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
9	NC_009515	ATTT	2	8	284	291	25 %	75 %	0 %	0 %	148642061
10	NC_009515	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
11	NC_009515	ATT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
12	NC_009515	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
13	NC_009515	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
14	NC_009515	T	9	9	490	498	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
15	NC_009515	ACAG	2	8	572	579	50 %	0 %	25 %	25 %	148642061
16	NC_009515	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
17	NC_009515	TAAA	2	8	608	615	75 %	25 %	0 %	0 %	148642061
18	NC_009515	T	6	6	630	635	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
19	NC_009515	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
20	NC_009515	AT	3	6	664	669	50 %	50 %	0 %	0 %	148642061
21	NC_009515	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
22	NC_009515	CAG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642061
23	NC_009515	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642061
24	NC_009515	TTTG	2	8	757	764	0 %	75 %	25 %	0 %	148642061
25	NC_009515	T	6	6	883	888	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
26	NC_009515	AAC	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
27	NC_009515	CAGCT	2	10	924	933	20 %	20 %	20 %	40 %	148642061
28	NC_009515	TGC	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642061
29	NC_009515	T	6	6	1020	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
30	NC_009515	TCC	3	9	1086	1094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642061
31	NC_009515	TGTTT	2	10	1122	1131	0 %	80 %	20 %	0 %	148642061
32	NC_009515	CTGTA	2	10	1176	1185	20 %	40 %	20 %	20 %	148642061
33	NC_009515	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
34	NC_009515	T	6	6	1217	1222	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
35	NC_009515	TGT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642061
36	NC_009515	TTA	2	6	1268	1273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
37	NC_009515	T	7	7	1280	1286	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
38	NC_009515	T	6	6	1305	1310	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
39	NC_009515	CTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
40	NC_009515	CAC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642061
41	NC_009515	ACA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
42	NC_009515	TAG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642061
43	NC_009515	ATC	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
44	NC_009515	T	7	7	1640	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
45	NC_009515	ATCA	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	148642061
46	NC_009515	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
47	NC_009515	TTC	2	6	1689	1694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
48	NC_009515	AATTT	2	10	1729	1738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009515	TAA	2	6	1740	1745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009515	A	7	7	1795	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009515	A	7	7	1812	1818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009515	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009515	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009515	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009515	T	6	6	1889	1894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009515	TA	4	8	1931	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009515	TAA	2	6	1959	1964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009515	AAAG	2	8	1977	1984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009515	TA	3	6	1997	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009515	A	7	7	2005	2011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009515	A	6	6	2043	2048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009515	A	6	6	2063	2068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009515	GAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
64	NC_009515	AACCT	2	10	2139	2148	40 %	20 %	0 %	40 %	148642062
65	NC_009515	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
66	NC_009515	GAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
67	NC_009515	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
68	NC_009515	ACA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
69	NC_009515	AT	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
70	NC_009515	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642062
71	NC_009515	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
72	NC_009515	A	7	7	2430	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
73	NC_009515	A	6	6	2443	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
74	NC_009515	AGCAA	2	10	2464	2473	60 %	0 %	20 %	20 %	148642062
75	NC_009515	GTTG	2	8	2564	2571	0 %	50 %	50 %	0 %	148642062
76	NC_009515	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
77	NC_009515	TGA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
78	NC_009515	TA	3	6	2646	2651	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
79	NC_009515	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
80	NC_009515	ATGAT	2	10	2737	2746	40 %	40 %	20 %	0 %	148642062
81	NC_009515	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
82	NC_009515	A	7	7	2810	2816	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
83	NC_009515	GCTGAA	2	12	2817	2828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642062
84	NC_009515	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
85	NC_009515	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
86	NC_009515	T	7	7	2845	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	148642062
87	NC_009515	AAG	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
88	NC_009515	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
89	NC_009515	TGA	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
90	NC_009515	GA	3	6	2925	2930	50 %	0 %	50 %	0 %	148642062
91	NC_009515	AC	3	6	2996	3001	50 %	0 %	0 %	50 %	148642062
92	NC_009515	AAC	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
93	NC_009515	AT	3	6	3086	3091	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
94	NC_009515	TAA	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
95	NC_009515	CTTT	2	8	3158	3165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009515	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009515	TAAAAT	2	12	3336	3347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009515	TTTA	2	8	3403	3410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009515	T	7	7	3416	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009515	TTA	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009515	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009515	TAA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009515	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009515	AT	4	8	3575	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009515	TA	3	6	3620	3625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009515	AAT	2	6	3626	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009515	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009515	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009515	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009515	AT	4	8	3716	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	AAT	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009515	TTA	2	6	3809	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009515	ATTTT	2	10	3835	3844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009515	AAT	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009515	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
116	NC_009515	ATA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642063
117	NC_009515	AGA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642063
118	NC_009515	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
119	NC_009515	CAG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
120	NC_009515	TAG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642063
121	NC_009515	TTA	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
122	NC_009515	TAT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
123	NC_009515	TGT	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642063
124	NC_009515	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
125	NC_009515	GCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642063
126	NC_009515	ACC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642063
127	NC_009515	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
128	NC_009515	CA	3	6	4289	4294	50 %	0 %	0 %	50 %	148642063
129	NC_009515	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009515	A	6	6	4369	4374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009515	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009515	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
133	NC_009515	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
134	NC_009515	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	148642064
135	NC_009515	ATA	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642064
136	NC_009515	TA	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	148642064
137	NC_009515	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
138	NC_009515	GTACCT	2	12	4640	4651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642064
139	NC_009515	TTTTCC	2	12	4689	4700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
140	NC_009515	TTA	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
141	NC_009515	A	6	6	4765	4770	100 %	0 %	0 %	0 %	148642064
142	NC_009515	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
143	NC_009515	CA	3	6	4886	4891	50 %	0 %	0 %	50 %	148642064
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146	NC_009515	TA	3	6	4985	4990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_009515	A	6	6	5550	5555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009515	TTGT	2	8	5591	5598	0 %	75 %	25 %	0 %	148642067
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283	NC_009515	ATT	2	6	9796	9801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
284	NC_009515	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
285	NC_009515	TAT	2	6	9826	9831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
286	NC_009515	AAT	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
287	NC_009515	T	6	6	9884	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	148642072
288	NC_009515	TAA	2	6	9924	9929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
289	NC_009515	TTA	2	6	10014	10019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
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299	NC_009515	GAA	2	6	10211	10216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_009515	TAA	2	6	10221	10226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_009515	TTTG	2	8	10233	10240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_009515	T	6	6	10291	10296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_009515	ATT	2	6	11042	11047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_009515	AT	3	6	11054	11059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_009515	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_009515	TAA	2	6	13275	13280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_009515	T	6	6	13838	13843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_009515	A	7	7	13877	13883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_009515	TTA	2	6	13926	13931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_009515	TCA	2	6	13972	13977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_009515	TTTA	2	8	14000	14007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_009515	TAA	2	6	14020	14025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_009515	CAA	2	6	14042	14047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_009515	ATTA	2	8	14052	14059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_009515	ATA	2	6	14062	14067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_009515	ATA	3	9	14069	14077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_009515	AAT	2	6	14078	14083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_009515	TTTA	2	8	14094	14101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_009515	AGG	2	6	14114	14119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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